Система управления состоит из вводных и силовых шкафов, шкафов автоматического управления (с программируемым контроллером), компьютеризироанного рабочего места оператора (промышленный компьютер, SCADA-система, программное обеспечение). Управление мельничным комплексом производится с рабочего места оператора, на котором запускается программа управления мельницей, программа учета продукции и сырья, программа фиксирующая все изменения состояния узлов и агрегатов системы и действия оператора.